Windows10をしばらく更新していなかったのですが重い腰を上げてOSをアップデートしてみたところ、PCを起動した際にシャットダウンする前に開いていたブラウザやフォルダが勝手に復元されるというか立ち上がるようになってしまいました。

調べてみるとどうにもWindows 10 Fall Creators Update（2017年10月）から追加された機能のようです。自分としてはシャットダウンや再起動したときは、すべて一度クリアにしたいのでこの気持ち悪い機能をオフすることにしました。

色々調べてみたのですが参考になったのは以下のサイトです。
Window 10で再起動時にアプリを自動的に実行させない方法
Windows 10 バージョン1709からのシャットダウン／再起動の新仕様、どうしよう？ (1/2)

設定を変える手順は、まずWindowsキーを押して、設定をクリック。
そして、アカウントの項目をクリック。

アカウントのサインインオプションの項目の下の方に行くと、「プライバシー」→「サインイン情報を使用してデバイスのセットアップを自動的に完了し、更新または再起動後にアプリを再び開くことができるようにします。」のチェックをオフにする。

これで、起動時に勝手にソフトが開くことが無くなりました。

また別の方法としてshutdownコマンドを使用すると対策ができるようです。
デスクトップに以下のショートカットを作成すると、シャットダウン・再起動ができます。

・シャットダウン
C:\Windows\System32\shutdown.exe -s -t 0
・再起動
C:\Windows\System32\shutdown.exe -r -t 0